Einige Isolate von B. fragilis sind in der Lage ein 20 kDa großes Metalloprotease-Toxin zu bilden und zu sekretieren. Die Wirkung entfaltet sich extrazellulär und führt u.a. über eine Proteolyse der Tight-Junction-Proteine zu einem Verlust der epithelialen Barrierefunktion. Dabei verursacht es eine Schwellung der menschlichen Colon-Epithelzellen, ohne die Zellen direkt zu schädigen. Intrazellulär findet eine Umverteilung der Actinfilamente statt. Neben den enterotoxischen Wirkungen scheint das Fragilysin noch weitere, bislang unbekannte pathologische Effekte zu besitzen, da auch bei 23% von B. fragilis-Isolaten aus extra-abdominalen Infektionsprozessen, insbesondere bei Blutkultur-Isolaten, eine Toxin-produktion nachweisbar ist.

ETBF wurden erstmals 1984 von Myers et al. beschrieben. Die Autoren wiesen bei abgebundenen Ileusschlingen von Kälbern und Lämmern einen sekretorischen Effekt nach. Später wurden solche Stämme in Assoziation mit Diarrhoe bei jungen Haustieren isoliert (Myers et al., 1987a, 1987b, 1989) 1987 wurden erstmals Isolate bei Menschen, Erwachsene und Kinder mit akuter und chronischer Diarrhoe beschrieben (Myers et al. 1987c). Die Besiedlung durch ETBF findet meist im frühen Kindesalter statt. Das in der Regel selbstlimitierend und gutartig verlaufende Krankheitsbild tritt gehäuft bei Kindern zwischen dem 1. und 5. Lebensjahr auf In einer kontrollierten Studie zeigte sich eine strenge Assoziation zwischen akuter Diarrhoe und ETBF bei Kindern, die älter als ein Jahr waren (Sack et al. 1992).

Eine jüngere Untersuchung an Kindern aus Bangladesch wies eine saisonale Häufung in den Sommermonaten auf. Erwerb von ETBF und Diarrhoe zeigten eine Korrelation mit Hühner- und Rinderhaltung, sodass diese als Risikofaktoren für die Erkrankung durch ETBF (Pathela et al., 2005) gesehen werden muss.